产品货号:
WE0187
中文名称:
土壤基因组DNA提取试剂盒
英文名称:
Soil gDNA Extraction Kit
产品规格:
50次
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本试剂盒适用于从新鲜或冷冻的干燥土壤、湿泥、淤泥及海河沉淀物中提取总DNA。本制品使用安全方便,单个样品操作一般可在40分钟内完成。使用本制品每克土壤可获得5μg以上的DNA,片段长度主要在20~30kb之间。本试剂盒采用独特的溶液能够有效去除杂质和腐殖酸,通过优化的缓冲系统使裂解液中的DNA高效结合到吸附柱上,土壤中残留的杂质、PCR和酶反应的抑制剂可通过两步洗涤步骤有效去除,最后使用低盐缓冲液或水洗脱,即可获得高纯度DNA。纯化得到的DNA可以直接用于酶切、PCR、Real-Time PCR、文库构建、Southern Blot、分子标记等下游实验。
组分 | 规格 |
Buffer QSL | 45mL |
Buffer RIL | 11mL |
Buffer ML | 10mL |
Buffer GW1(浓缩) | 13mL |
Buffer GW2(浓缩) | 26mL |
Buffer EBL | 13mL |
RNase A | 240μL |
Lysis Tubes II | 50个 |
吸附柱DM及收集管 | 50套 |
保存:室温,其中Buffer RIL需置于2~8℃保存。
- 恒温混匀仪
- 无水乙醇,异丙醇
- 涡旋振荡仪或组织研磨仪
- 样品应避免反复冻融,否则会导致提取的DNA片段较小且提取量下降。
- 第一次使用前应按照试剂瓶标签的说明预先在Buffer GW1(浓缩)和Buffer GW2(浓缩)中加入无水乙醇。
- Buffer RIL待即将使用前取出,用完立即放在2~8℃储存。
- 短暂离心Lysis Tube以使珠子沉淀在底部。
- 样本收集
- 向Lysis Tube中加入0.1~0.3g土壤或粪便样本,加入740~820μL Buffer QSL与4μL RNase A,旋紧管盖,短暂涡旋以混合。
- 若为非裂解型粪便保存液[例如粪便采集保存管(货号:WE0423)]保存的粪便样本,向Lysis Tube中加入200μL~600μL固液混合物,13000rpm离心1min,弃掉保存液(若离心后的固体量过少,可再次富集,但不宜超过0.3g)。加入620μL Buffer QSL和4μL RNase A,旋紧管盖,短暂涡旋以混合。
- 向Lysis Tube中加入0.1~0.3g土壤或粪便样本,加入740~820μL Buffer QSL与4μL RNase A,旋紧管盖,短暂涡旋以混合。
- 将Lysis Tube固定在装有2mL适配器的振荡研磨装置中,并根据您的设备使用优化的研磨条件进行处理(参见附录)。
- 将Lysis Tube在恒温混匀仪上以70℃,1200rpm振荡10min。随后13000rpm离心2min以沉淀固体颗粒。转移540μL上清液至新的2mL离心管。
- 加入180μL Buffer RIL,涡旋5sec,13000rpm离心2min。
注意:Buffer RIL待即将使用前取出,用完立即放在2~8℃储存。 - 在新的离心管中依次加入160μL Buffer ML、480μL步骤5的上清液、320μL异丙醇,涡旋5秒。
- 将上步中溶液转移650μL到到已装入收集管的吸附柱DM中,12000rpm(~13400×g)离心1分钟。
- 倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。重复步骤7直至溶液全部转移完。
- 向吸附柱中加入500μL Buffer GW1(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
- 向吸附柱中加入500μL Buffer GW2(使用前检查是否已加入无水乙醇),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。
- 重复步骤10。
- 12000rpm离心2分钟,倒掉收集管中的废液。将吸附柱置于室温数分钟,以彻底晾干。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的乙醇去除,乙醇的残留会影响后续的酶促反应(酶切、PCR等)。 - 将吸附柱置于一个新的离心管(自备)中,向吸附柱的中间部位悬空滴加50~200μL Buffer EBL或灭菌水,室温放置2~5分钟,12000rpm离心1分钟,收集DNA溶液,-20℃保存DNA。
注意:- 离心之前室温孵育5分钟可以增加产量。
- 用另外的50~100μL洗脱缓冲液或灭菌水再次洗脱可以增加产量。
- 如果要提高DNA的终浓度,可以将步骤13所得的DNA洗脱液重新加至吸附膜上,重复步骤13,但可能会减少总产量。
- 洗脱缓冲液不含螯合剂,请置于-20℃保存DNA。
- 基因组DNA模板中残余的微量PCR抑制物可能对PCR反应产生不良影响,可将DNA稀释2~10倍通常即可解决。
- 离心之前室温孵育5分钟可以增加产量。
附录:使用以下方法之一研磨样本
- 在涡旋振荡仪上以最大速度手动涡旋振荡10分钟。
- 在搭配有1.5~2mL水平离心管支架的涡旋振荡仪上以最大速度振荡10分钟(让Lysis Tube保持水平放置)。若样本数量超过12,延长5~10分钟。
例如使用Scientific Industries或Mobio的Vortex-Genie2涡旋振荡仪。 - 使用Qiagen的TissueLyser II时,以25Hz研磨10分钟。
- 使用Qiagen的PowerLyzer 24 Homogenizer时,以2000rpm的速度均质化30秒,暂停30秒,然后以2000rpm的速度再次均质化30秒。
- 使用MP Biomedicals的FastPrep-24时,推荐速度为6.0,时间为40秒。
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